Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD1O95696 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD1O95696 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD1O95696 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD1O95696 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD1O95696 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD1O95696 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD1O95696 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD1O95696 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRD1O95696 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD1O95696 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD1O95696 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD1O95696 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD1O95696 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD1O95696 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD1O95696 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD1O95696 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD1O95696 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD1O95696 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD1O95696 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD1O95696 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD1O95696 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD1O95696 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD1O95696 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD1O95696 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD1O95696 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD1O95696 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD1O95696 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD1O95696 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD1O95696 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD1O95696 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD1O95696 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD1O95696 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD1O95696 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD1O95696 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD1O95696 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD1O95696 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD1O95696 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD1O95696 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD1O95696 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD1O95696 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD1O95696 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD1O95696 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD1O95696 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD1O95696 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD1O95696 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD1O95696 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD1O95696 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD1O95696 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD1O95696 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD1O95696 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD1O95696 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD1O95696 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD1O95696 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD1O95696 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms