Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms