Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB11O95342 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms