Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPBO95292 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPBO95292 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPBO95292 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPBO95292 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPBO95292 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPBO95292 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPBO95292 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPBO95292 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms