Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UFL1O94874 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UFL1O94874 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UFL1O94874 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UFL1O94874 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UFL1O94874 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UFL1O94874 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UFL1O94874 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UFL1O94874 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UFL1O94874 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UFL1O94874 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UFL1O94874 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UFL1O94874 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UFL1O94874 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UFL1O94874 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UFL1O94874 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UFL1O94874 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UFL1O94874 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UFL1O94874 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UFL1O94874 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UFL1O94874 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UFL1O94874 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UFL1O94874 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UFL1O94874 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UFL1O94874 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UFL1O94874 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UFL1O94874 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UFL1O94874 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UFL1O94874 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UFL1O94874 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UFL1O94874 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UFL1O94874 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UFL1O94874 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UFL1O94874 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UFL1O94874 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UFL1O94874 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UFL1O94874 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UFL1O94874 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UFL1O94874 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UFL1O94874 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UFL1O94874 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UFL1O94874 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UFL1O94874 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UFL1O94874 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UFL1O94874 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UFL1O94874 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UFL1O94874 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UFL1O94874 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UFL1O94874 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UFL1O94874 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UFL1O94874 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UFL1O94874 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UFL1O94874 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UFL1O94874 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UFL1O94874 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UFL1O94874 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UFL1O94874 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UFL1O94874 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UFL1O94874 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UFL1O94874 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UFL1O94874 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UFL1O94874 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UFL1O94874 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UFL1O94874 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UFL1O94874 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UFL1O94874 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UFL1O94874 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UFL1O94874 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UFL1O94874 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UFL1O94874 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UFL1O94874 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UFL1O94874 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UFL1O94874 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UFL1O94874 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UFL1O94874 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UFL1O94874 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UFL1O94874 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UFL1O94874 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UFL1O94874 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UFL1O94874 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UFL1O94874 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UFL1O94874 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms