Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCATO75600 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCATO75600 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCATO75600 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCATO75600 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCATO75600 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCATO75600 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCATO75600 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCATO75600 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCATO75600 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GCATO75600 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GCATO75600 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCATO75600 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCATO75600 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCATO75600 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCATO75600 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCATO75600 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCATO75600 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCATO75600 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCATO75600 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCATO75600 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCATO75600 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms