Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CILPO75339 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CILPO75339 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CILPO75339 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CILPO75339 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CILPO75339 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CILPO75339 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CILPO75339 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CILPO75339 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILPO75339 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILPO75339 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILPO75339 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILPO75339 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILPO75339 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILPO75339 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILPO75339 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILPO75339 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CILPO75339 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CILPO75339 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms