Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIA4O75335 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms