Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3O43889 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3O43889 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3O43889 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3O43889 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CREB3O43889 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CREB3O43889 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CREB3O43889 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CREB3O43889 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3O43889 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3O43889 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3O43889 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3O43889 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3O43889 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3O43889 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3O43889 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3O43889 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3O43889 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3O43889 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3O43889 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3O43889 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3O43889 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3O43889 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3O43889 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms