Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR2O43760 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR2O43760 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms