Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms