Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSH5O43196 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSH5O43196 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSH5O43196 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSH5O43196 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSH5O43196 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSH5O43196 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSH5O43196 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSH5O43196 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSH5O43196 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSH5O43196 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSH5O43196 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MSH5O43196 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSH5O43196 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSH5O43196 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSH5O43196 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSH5O43196 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSH5O43196 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSH5O43196 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSH5O43196 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSH5O43196 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MSH5O43196 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSH5O43196 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSH5O43196 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSH5O43196 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSH5O43196 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSH5O43196 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MSH5O43196 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSH5O43196 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSH5O43196 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MSH5O43196 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSH5O43196 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSH5O43196 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSH5O43196 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSH5O43196 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSH5O43196 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSH5O43196 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSH5O43196 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSH5O43196 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSH5O43196 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MSH5O43196 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSH5O43196 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSH5O43196 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSH5O43196 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSH5O43196 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSH5O43196 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSH5O43196 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSH5O43196 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSH5O43196 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSH5O43196 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSH5O43196 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSH5O43196 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSH5O43196 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSH5O43196 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSH5O43196 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSH5O43196 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSH5O43196 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSH5O43196 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSH5O43196 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSH5O43196 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSH5O43196 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSH5O43196 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSH5O43196 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSH5O43196 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
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