Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLXNB1O43157 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXNB1O43157 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms