Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR1CO15160 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms