Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARNTLO00327 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARNTLO00327 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms