Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF10AO00220 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms