Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H7C1W4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H7C1W4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H7C1W4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1W4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1W4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1W4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1W4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1W4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H7C1W4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
H7C1W4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H7C1W4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
H7C1W4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1W4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1W4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1W4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1W4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1W4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1W4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1W4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1W4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1W4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1W4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1W4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1W4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1W4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1W4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1W4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1W4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1W4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1W4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1W4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1W4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1W4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms