Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms