Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HHLA1C9JL84 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms