Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms