Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXI3A8MTJ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXI3A8MTJ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms