Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SOBPA7XYQ1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms