Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KNCNA6PVL3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms