Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL13PA6NNM8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms