Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85CA6NKD9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms