Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HELTA6NFD8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HELTA6NFD8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms