Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM3A6NDB9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALM3A6NDB9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms