Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 32
SF3B1O75533 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.732e-6■■■■■ 32
SF3B1O75533 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.188e-9■■■■■ 32
SF3B1O75533 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.178e-9■■■■■ 32
SF3B1O75533 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.168e-9■■■■■ 32
SF3B1O75533 ANKHD1-207ENST00000421134 4814 ntTSL 518.45■□□□□ 0.548e-9■■■■■ 32
SF3B1O75533 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.168e-9■■■■■ 32
SF3B1O75533 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.118e-9■■■■■ 32
SF3B1O75533 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.178e-9■■■■■ 32
SF3B1O75533 ANKHD1-201ENST00000246149 2062 ntTSL 28.37□□□□□ -1.078e-9■■■■■ 32
SF3B1O75533 INTS11-223ENST00000498173 1589 ntTSL 223.16■■□□□ 1.36e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.236e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 INTS11-220ENST00000493534 896 ntTSL 321.39■■□□□ 1.016e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 INTS11-224ENST00000498476 554 ntTSL 420.52■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 INTS11-239ENST00000531019 549 ntTSL 420.52■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 INTS11-215ENST00000470679 584 ntTSL 520.44■□□□□ 0.866e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 INTS11-219ENST00000490853 704 ntTSL 320.3■□□□□ 0.846e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 INTS11-221ENST00000496353 2428 ntTSL 218.53■□□□□ 0.566e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 INTS11-226ENST00000525285 579 ntTSL 416.1■□□□□ 0.176e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 INTS11-244ENST00000532952 773 ntTSL 314.85□□□□□ -0.036e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 INTS11-246ENST00000534345 485 ntTSL 412.97□□□□□ -0.336e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 56.69□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 DHX36-210ENST00000481941 2612 ntTSL 24.68□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 ZNF692-214ENST00000483223 901 ntTSL 319.55■□□□□ 0.728e-7■■■■■ 31.9
SF3B1O75533 LEPR-204ENST00000371059 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.91e-7■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.259e-13■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 GSTP1-205ENST00000494593 1681 ntTSL 221.02■□□□□ 0.969e-13■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.079e-13■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 GSTP1-203ENST00000467591 736 ntTSL 212.52□□□□□ -0.419e-13■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 GSTP1-207ENST00000498765 723 ntTSL 310.65□□□□□ -0.79e-13■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 ENPP3-205ENST00000427707 1536 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 AFDN-217ENST00000507679 670 ntTSL 38.59□□□□□ -1.039e-13■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.963e-6■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 SREBF1-223ENST00000584760 564 ntTSL 214.56□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 SPOPL-202ENST00000420679 1386 ntTSL 58.12□□□□□ -1.114e-8■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 HECTD4-213ENST00000550968 2313 ntTSL 211.22□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 HECTD4-205ENST00000547519 1655 ntTSL 36.78□□□□□ -1.328e-7■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 NUP214-216ENST00000526346 577 ntTSL 47.54□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 TMEM57-203ENST00000470035 559 ntTSL 31.45□□□□□ -2.184e-8■■■■■ 31.8
SF3B1O75533 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 221.99■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 31.7
SF3B1O75533 SLC25A36-202ENST00000393015 659 ntTSL 521.64■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 31.7
SF3B1O75533 SLC25A36-214ENST00000515813 738 ntTSL 220.06■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 31.7
SF3B1O75533 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 31.7
SF3B1O75533 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 28.41□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 31.7
SF3B1O75533 ZNF692-220ENST00000496411 1064 ntTSL 323.03■■□□□ 1.287e-7■■■■■ 31.7
SF3B1O75533 SLC3A2-220ENST00000542922 2174 ntTSL 214.06□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 31.7
SF3B1O75533 ARFGAP1-208ENST00000518691 1162 ntTSL 221.22■□□□□ 0.994e-7■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 LSM14A-207ENST00000589878 559 ntTSL 420.37■□□□□ 0.856e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.556e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-15■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 LSM14A-205ENST00000586157 944 ntTSL 515.55■□□□□ 0.086e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 RPS27L-206ENST00000482846 2944 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.076e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.096e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.236e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 CFAP36-205ENST00000407816 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-15■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.346e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 CFAP36-202ENST00000349456 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-15■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 RTN3-209ENST00000538995 814 ntTSL 212.69□□□□□ -0.389e-12■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 MAP4-213ENST00000477765 284 ntTSL 311.56□□□□□ -0.566e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 RTN3-201ENST00000338850 493 ntTSL 211.15□□□□□ -0.629e-12■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 VPS52-217ENST00000478934 2602 ntTSL 210.99□□□□□ -0.656e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 ZNF480-206ENST00000598016 559 ntTSL 49.71□□□□□ -0.866e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 RICTOR-209ENST00000514735 686 ntTSL 37.84□□□□□ -1.156e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.236e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 VPS52-219ENST00000493379 786 ntTSL 57.25□□□□□ -1.256e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.256e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 RPS27L-207ENST00000559763 244 ntTSL 36.56□□□□□ -1.366e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.396e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.426e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 RICTOR-208ENST00000513566 1762 ntTSL 1 (best)6.17□□□□□ -1.426e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 ZNF480-203ENST00000468240 2527 ntTSL 26.05□□□□□ -1.446e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.656e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 SCFD1-211ENST00000554437 688 ntTSL 34.01□□□□□ -1.776e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.936e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 CFAP36-206ENST00000481791 519 ntTSL 22.77□□□□□ -1.972e-15■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 TAF15-203ENST00000603393 1214 ntTSL 1 (best)18.3■□□□□ 0.529e-7■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)6.02□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 31.6
SF3B1O75533 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 522.76■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 31.5
SF3B1O75533 MORC3-203ENST00000485299 687 ntTSL 32.85□□□□□ -1.953e-6■■■■■ 31.5
SF3B1O75533 XPO1-208ENST00000437159 537 ntTSL 52.29□□□□□ -2.042e-7■■■■■ 31.5
SF3B1O75533 SEC63-207ENST00000466419 606 ntTSL 34.14□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 31.5
SF3B1O75533 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 218.71■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.093e-6■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 AURKAIP1-205ENST00000489799 695 ntTSL 1 (best)26.28■■□□□ 1.83e-6■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 AURKAIP1-206ENST00000496905 608 ntTSL 220.13■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 31.4
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 3206.6 ms