Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN6Q9Y6Q1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms