Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PARP3Q9Y6F1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms