Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms