Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX9Q9Y5X1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms