Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD2APQ9Y5K6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms