Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4BQ9Y4P1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms