Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP15Q9Y4E8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms