Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP3Q9Y446 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP3Q9Y446 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms