Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1Q9Y3L3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms