Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFR3BQ9Y2G0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms