Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms