Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms