Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms