Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
THSD7AQ9UPZ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
THSD7AQ9UPZ6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms