Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms