Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms