Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF1Q9UMS5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms