Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRPF19Q9UMS4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPF19Q9UMS4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms