Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRIP2Q9ULQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP2Q9ULQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms