Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS11EQ9UL52 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.6 ms