Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms