Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP8AP2Q9UKL3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP8AP2Q9UKL3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms